微信小程序原生开发的优点包括：
1. 性能更高：使用小程序原生开发可以获得更高的性能，因为原生开发可以直接调用微信小程序的底层API，而不需要通过中间层进行转换，从而提高了程序的运行效率。
2. 功能更丰富：使用小程序原生开发可以获得更丰富的功能，因为原生开发可以直接调用微信小程序的底层API，而这些API包括了大量的功能，可以让开发者更加灵活地实现自己的需求。
3. 开发效率更高：使用小程序原生开发可以获得更高的开发效率，因为原生开发可以使用更加便捷的开发工具，例如微信开发者工具，可以帮助开发者更加方便快捷地进行开发和调试。
4. 更好的用户体验：使用小程序原生开发可以获得更好的用户体验，因为原生开发可以更好地控制程序的性能和功能，从而可以更好地满足用户的需求和期望。
综上所述，微信小程序原生开发具有性能更高、功能更丰富、开发效率更高和更好的用户体验等优点，因此在开发微信小程序时，可以优先考虑使用原生开发。